Phim "Đội Quân Chống Buôn Lậu" xoay quanh Huy, một thanh tra trẻ của Hải quan, còn thiếu kinh nghiệm trong công việc. Ban đầu, Huy và cấp dưới là Diệp thường xuyên bất đồng ý kiến, nhưng dần dần họ phát triển mối quan hệ thân thiết và tìm được sự hòa đồng. Tuy nhiên, mọi chuyện trở nên phức tạp khi Huy phát hiện cha ruột của mình liên quan đến một vụ buôn lậu. Trong bối cảnh áp lực và tai tiếng, Huy quyết định trở thành tay trong để điều tra và cùng Diệp triệt phá một tập đoàn buôn lậu lớn, từ đó khẳng định trách nhiệm và lòng dũng cảm của mình.